清华大学万科公共卫生与健康学院研究生奖励荣誉体系突出奖励优秀、树立榜样的作用，主要表彰在学术研究、社会工作等方面表现优秀的研究生，包括特等奖学金、国家奖学金、综合优秀奖学金（一等、二等）、单项奖学金及院管奖学金等。

同时，为了帮助家庭经济困难的研究生顺利完成学业，解决其部分在校期间基本生活和学习费用，特别是帮助研究生应对突发性经济困难，学校建立了包括助学金、突发性困难补助、国家助学贷款等项目在内的研究生助困应急体系。